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《內經圖》除了圖，本身含有許多詩句，其實都是對於圖內運行的說明，特此解釋。
1、
鐵牛耕地種金錢：指搬運腎氣，搬運工夫有牛車、羊車、鹿車之分，因為初煉，故用牛車。所種金錢，隱喻所耕耘收穫乃珍貴者，借喻金丹。
刻石兒童把貫穿：把金錢貫串，天機在其中，須珍而重之。刻石兒童，暗喻刻圖者。兒童把貫串成北斗，《破迷正道歌》雲「若遇神仙親指訣，捉住北斗周天輪」，此之謂也。
一粒粟中藏世界：小宇宙等同大宇宙，丹頭種子即整個生命之源。
半升鐺內煮山川：山川大宇宙，玄機亦同鐺內烹煮工夫。主在火候。
白頭老子眉垂地：白頭者，氣也。指氣從督脈上，再引導陰液沿頭面下降。
碧眼胡僧手托天：手托天指搭鵲橋，任督二脈因舌頂上顎而使氣暢通。
若問此玄玄會得：明通造化之機，此工夫是終極。
此玄玄外更無玄：除此以外，並無其他。
2、
我家端種自家田：人身中有可耕之田，不用外求。
可育靈苗活萬年：身中之田可養活生命，長生不死。
花似黃金苞不大：所開之花是金花，不太大。金花即真炁。初起之苞為丹種，幼嫩而細小。
子如玉粒果皆圓：大小僅似粟米。
栽培全藉中宮土：意是工夫的重點。
灌溉須憑上谷泉：氣往上走，上丹田有液下流。
有朝一日功行滿：火候足，工夫到，
直至功行果滿。 便是蓬萊大羅仙：大羅金仙，仙界中之最。
3、眾妙之門何處求，機關撥轉水逆流；萬丈深潭應見底，甘泉湧起滿山頭：水逆流，因腎水往上沖，故逆流。腎氣為後天功能，自先天腎水出，全賴「鐵牛耕地」所致，牛車搬運上山脊之象。山頭，即頭頂。腎氣到頂，自口中生津液而為甘泉湧起。此乃氣多生液、任督相通之貌。
4、腎神名玄冥、字育嬰：見《黃庭經·心神章第八》。
5、心神名丹元、字守靈：見《黃庭經·心神章第八》。
6、肝神龍煙字含明：見《黃庭經·心神章第八》。
7、肺神皓華字虛成：見《黃庭經·心神章第八》。
8、膽神龍曜字威明：見《黃庭經·心神章第八》。
注意：此圖五臟欠脾，六腑只提到膽。脾為中央土，以意喻之，乃交接水火之媒介，修煉工夫本已有之，不可或缺，故不作煉臟腑神之用。至於膽，此為六腑之一。本來五臟均主藏精不泄，六腑主傳化物而不藏，但功能上膽卻藏五臟之精汁，故特別予以強調。後世以「三焦」替代膽為六腑之代表角色，如「六字訣」。
9、後三關：尾閭下關、夾脊中關、玉枕上關合稱三關。此三關之位置，發展至鍾呂，有不同之描述。《靈寶畢法，肘後飛金晶第五》鍾呂認為，天柱為上關，相當於頸椎第三節下；神道為中關，相當於胸椎第五節下；命門為下關，相當於腰椎第二節下。
10、前三丹田：下丹田氣海、中丹田絳宮、上丹田泥丸。
11、十二樓台藏秘訣：十二重樓，即喉軟骨。秘訣者，此在氣液相交之際，咽津或咽氣以逆求丹種之謂也。
12、陰陽玄牝車：玄牝，是萬物所由生之所。陳摶借用為「煉精化氣」之預備工夫。此借玄牝車喻丹種之出現，在陰陽混沌於橐龠，真炁由此而出之貌。《老子?第6章》：「穀神不死，是謂玄牝。玄牝之門，是謂天地根。綿綿若存，用之不勤。」
13、水火交接地：此地劃於下丹田，說明真炁萌生於此，《悟真篇》雲「要知產藥川源處，只在西南是本鄉」，及「依他坤位生成體，種在乾家交感宮」，皆是此意。
14、夾脊雙關透頂門，修行路徑此為根：氣必循夾脊上行，此乃鍊氣的基本方法。氣到頭頂，頭頂上有泥丸宮，為修煉之終極。